سيدمحمد خاتمی، ریيس جمهوری پیشین ايران، به اظهارات مخالفان خود مبنی بر اینکه «اگر تروری رخ دهد مسوولیت آن با خاتمی است»، واکنش نشان داده و گفته است که «به من یزدی می‌خورد که اهل ترور باشم؟»
آقای خاتمی روز دوشنبه ۱۵ مهر و در پاسخ به اين سوال که آيا شما برنامه‌ای برای ترور داريد؟ گفته است: «به من يزدی که گفت‌وگوی تمدن‌ها را مطرح کرده‌ام اصلا می‌خورد که اهل ترور باشم؟»
به گزارش خبرگزاری ايسنا، او افزوده که فقط «هشدار» داده که «افراطی‌گری ممکن است به ترور بيانجامد، منظورم اين نيست که کسی قصد ترور دارد. ما خودمان مورد ترور قرار گرفته‌ايم.»
به گفته آقای خاتمی، «اين تخريب‌ها نمونه افراطی‌گری است، جامعه بايد به سوی منطق برود و بايد نقد منطقی جايگزين اعتراض تخريبی شود.»
ریيس جمهوری پیشین ايران هفته گذشته با اشاره به تجمع عده‌ای در فرودگاه مهرآباد و پرتاب کفش به سوی خودروی حسن روحانی هنگام بازگشت از سفر نيويورک هشدار داد که اگر با جريان‌های تخريبی برخورد نشود منجر به ترور می‌شود.
او گفت که «نقد با تخريب متفاوت است» و افزود: «اگر جلوی جريانات تخريبی گرفته نشود مثل زمان اصلاحات می‌شود که اوايل اين طور بود و بالاخره منجر به ترور شد.»
روز شنبه، ششم مهر، در حالی که چندصد نفر برای استقبال از ریيس جمهوری ايران به فرودگاه مهرآباد تهران آمده بودند، عده‌ای در اعتراض به تماس‌های مقام‌های ايران و آمريکا عليه حسن روحانی شعار دادند و به سوی خودروی او کفش پرتاب کردند.
آقای خاتمی در واکنش به اين حادثه درباره احتمال «ترور» در کشور هشدار داده و گفته بود که «جرياناتی به دنبال خشونت هستند و رای مردم را برنمی‌تابند.»
اين سخنان ریيس جمهوری پيشين ايران با واکنش تند تعدادی از اصول‌گرايان روبرو شد. از جمله احمد سالک، نماينده اصفهان در مجلس شورای اسلامی با بيان اينکه «ترور يادآور روزهايی است که اصلاح‌طلبان افراطی سر کار بودند»، گفت: «با توجه به اظهارات خاتمی، از اين پس هر اتقاق ضدامنيتی در قالب ترور رخ دهد، مسئوليت آن متوجه خاتمی خواهد بود.»
او گفت که آقای خاتمی «با آگاهی و اطلاع درباره ترور فيزيکی اظهارنظر کرده بنابراين دستگاه‌های امنيتی فوراً بايد از خاتمی درباره اظهاراتش توضيح بخواهند.»
مهدی کوچک‌زاده، نماينده تهران در مجلس نيز، مسئوليت ترور سعيد حجاريان، عضو دوره اول شورای شهر تهران و مشاور اسبق آقای خاتمی در دوران رياست جمهوری و در سال ۱۳۷۸ را متوجه «دوستان آقای خاتمی» کرد و گفت که «احتمالا آقای خاتمی از حرکات تروريست‌ها اطلاع دارد.»
او با اشاره به سيدمحمد خاتمی گفت که «سابقه اين آقايان برای ما روشن است و برنامه‌ريزی کردن برای به تشنج کشاندن کشور در فتنه ۸۸ داشتند، نمونه از اقدامات ضدامنيتی اين آقايان است.»
حميد رسايی، ديگر نماينده تهران در مجلس نيز دیدگاه مشابهی را ابراز کرد. آقای رسايی در يادداشتی با اشاره به سخنان آقای خاتمی و جناح اصلاح‌طلب نوشت که اين جريان «در سال‌های دوره حاکميت اصلاحات آمريکايی با سازماندهی قتل‌های زنجيره‌ای، کوی دانشگاه و ترور سعيد حجاريان مقدمات تخريب سه رکن مهم وزارت اطلاعات، نيروی انتظامی و سپاه و بسيج را فراهم کرد، در آينده مقدمات روانی ديگری را کليد خواهد زد تا اين چشم‌های نظام را مجددا در نگاه افکار عمومی تخريب و مقدمه نفوذ خود برای انتخابات مجلس دهم را آماده کند.»
آقای خاتمی روز دوشنبه در واکنش به اين سخنان گفته که «اينها حرف‌های بی‌‌خودی است و کسانی که ناراحت هستند مردم اصلاحات و اعتدال را به افراط‌گری ترجيح داده‌اند آن را مطرح می‌کنند. آنها فقط به دنبال جبران شکستی هستند که از مردم خورده‌اند.»